补充协议在合同中能否单独进行结算？

补充协议能否单独结算需视情况而定。依据《合同法》，若主合同已履行，则主合同及补充协议均有效，可单独结算；若主合同未生效，补充协议能否单独结算取决于其能否独立履行。未能及时处理可能导致合同纠纷，影响权益保护。
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补充协议结算视情况。主合同已履行，则补充协议可单独结算；未履行时，操作如下：1.评估补充协议能否独立履行，能则单独结算；2.不能独立履行，需等待主合同生效或协商修改补充协议；3.若存在争议，可寻求法律途径解决，确保合同权益。
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处理补充协议结算问题，需根据主合同履行情况判断。若主合同已履行，则补充协议可单独结算；若未履行，需评估补充协议能否独立履行来选择处理方式。选择时应考虑合同的整体性和补充协议的独立性。